NBA生涯Part2
很不幸的是，邓肯在接下来几个赛季里都打得异常辛苦。大卫-罗宾逊、肖恩-埃利奥特、艾弗里-约翰逊等多名99年冠军成员都已经走向职业生涯末年的低谷期，原本叱咤风云的“双塔”组合更多的只是邓肯这一“单塔”持续发威。
与此同时，洛杉矶湖人悄然崛起，他们内线拥有强力中锋沙奎尔-奥尼尔，外线则是超级新星科比-布莱恩特，再加上主帅菲尔-杰克逊运筹帷幄，紫金军团拿到了那个赛季的常规赛最佳战绩。
马刺在常规赛表现中规中矩，邓肯的发挥继续稳定。场均20分10个篮板，再加上在防守端的杰出表现，他再一次入选NBA第一阵容。他在2001-02赛季常规赛场均得分达到职业生涯新高的25.5分，也获得了自己的首个常规赛MVP称号。
但是邓肯一人的努力无法换来马刺全队在季后赛的成功，他们在夺冠后连续几个赛季都早早出局。2000年，距离季后赛开赛前四场比赛，邓肯半月板撕裂只好作壁上观。最终邓肯衣装革履的在替补席上看着球队首轮就以1-3的总比分倒在了太阳脚下。2001和2002年，马刺连续两次在季后赛遭遇鼎盛时期的湖人，也连续两次倒在了对手脚下。2001年马刺以0-4的比分被湖人横扫，整个系列赛科比场均拿下33分，奥尼尔得到27分11篮板。尽管邓肯的个人表现值得肯定，但是远不足以撼动湖人当时的霸主地位。
2002-03赛季对于马刺来说看似又是一个平凡的赛季。年轻的法国控卫托尼-帕克发挥一直时好时坏，新来的意大利联赛MVP马努-吉诺比利尚需时间来适应NBA和欧洲篮球之间的巨大差异。37岁的罗宾逊宣布自己会在赛季末正式退役，他为邓肯保驾护航的使命似乎也要就此告终。从这个状元秀来到队中后这个新老传承就已经上演，海军上将默默得将属于自己的交接棒递在了邓肯手中。他表示自己对邓肯给予高度的信任，他期待自己职业生涯的最后一个赛季可以与马刺一同再度捧起奥布莱恩奖杯。
在双塔组合的告别赛季里，两人得到了外线球员强有力的火力支持。帕克和吉诺比利异军突起，布鲁斯-鲍文在防守端屡建奇功。2002-03赛季马刺在常规赛拿到了不可思议的60胜，邓肯连续第二个赛季获得常规赛MVP，他的场均篮板数达到职业生涯新高的13个。
季后赛，他们首轮以4-2的比分射落太阳，第二轮等待他们的的又是OK组合领衔的老对手洛杉矶湖人。马刺旗开得胜，在自己的主场SBC中心连续抢到两场胜利，以2-0的比分占据优势。紫金军团自然不会轻易放弃，回到斯坦普斯中心的他们重振旗鼓，连胜两场还以颜色。第五场天王山之战显得尤为重要，马刺在前三节顺风顺水，最多时拥有25分的领先优势，第四节开始时依然分差还保持在16分。然而最后一节风云突变，科比和奥尼尔联手发威，马刺的领先优势瞬间化为乌有。比赛还剩15秒时史蒂芬-杰克逊2罚1中，马刺仅以2分领先。最后1.6秒，罗伯特-霍里篮筐左侧三分不中，马刺有惊无险的拿到赛点。这场比赛，邓肯交出了一份27分15篮板5助攻的答卷。
第六场是一场一边倒的比赛，马刺在客场以摧枯拉朽之势将三冠王湖人彻底击溃。比分最终定格在了110-82，马刺以4-2的总比分晋级西部决赛。他们终于掀翻了连续两个赛季挡在前进道路上的冠军之师，瓦解了当时不可一世的紫金王朝。邓肯全场25投16中，拿下37分并抢下16个篮板。此时的邓肯也不再是一人苦苦支撑，得到27分的帕克同样为晋级下一轮立下了汗马功劳。
接下来他们以4-2同样的比分战胜德克-诺维茨基率领的达拉斯小牛，总决赛等待他们的对手是连续第二个赛季获得东部冠军的新泽西篮网。
就像马刺在得到邓肯后迅速强势反弹一样，在2001年通过交易获得贾森-基德的篮网也很快得走上了一条重塑辉煌之路。他们这是连续第二个赛季闯入NBA总决赛，很多人在常规赛就认为基德比邓肯更有资格获得MVP殊荣。这个赛季的季后赛进行到现在邓肯已然渐入佳境，总决赛他用自己完美的表现给那些质疑他的人一记响亮的耳光。在与全明星大前锋肯扬-马丁的对决中邓肯完虐对手，其中包括第六场自己砍下了令人无法相信的准四双数据：21分，20篮板，10助攻，8封盖。6场系列赛下来他创造了总决赛封盖新纪录——32次。
马刺拿到队史第二座总冠军奖杯，而邓肯也众望所归的获得自己的第二个总决赛MVP称号。以NBA总冠军成员身份告别职业生涯的罗宾逊，可以放心地将自己守卫圣城荣誉的职责，担在另一个高个子的肩上。